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解決片段化DNA文庫制備中樣品大小和上樣量的局限性,自動化方法簡化NGS文庫制備

作者:admin 信息來源:達科為 日期:20190612 打印 字體:  
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隨著二代測序技術(shù)的不斷發(fā)展,其應用范圍更加廣泛,但其技術(shù)局限性、結(jié)果的一致性和可靠性等問題也逐漸暴露出來。如何對NGS文庫制備的步驟進行優(yōu)化?如何確保樣品處理的一致性、方法的可靠性?本次講座將為您答疑解惑。

講座時間:2018年7月11日    21:00

直達鏈接:http://t.cn/RdncVsn(請點擊閱讀原文查看)

第一部分  突破NGS的局限:小片段和局限性樣本的文庫構(gòu)建

主持人:Scott Monsma


隨著下一代DNA測序的普及,研究人員致力于突破當前技術(shù)的極限,以適應具有挑戰(zhàn)性的樣品類型和新型應用的產(chǎn)生。為了使這些實驗成為可能,必須對PCR-free和基于PCR擴增的NGS文庫制備過程中的多個步驟進行優(yōu)化。本次講座將探討從上樣量低至50 pg的樣品和100 bp以下的超小片段構(gòu)建高質(zhì)量文庫所涉及的一些關(guān)鍵因素。同時,將分享cfDNA和ChIP上樣量以及微小合成寡核苷酸的數(shù)據(jù)。

第二部分    通過自動化解決樣品制備中的難題

主持人:Phil Farrelly


與手動方法相比,自動化方法(尤其是液體處理方法)可以大大提高結(jié)果的一致性和可靠性。NGS樣品制備是實驗操作的一個例子,該實驗中使用自動移液器制備樣品與手動方法相比表現(xiàn)出明顯優(yōu)勢。使用遵循既定程序的自動移液器提高了樣品處理的一致性,方法性能的可靠性,并確保了數(shù)據(jù)跟蹤和記錄的準確性。本次講座將提供具體示例,說明操作過程中自動移液和自動化控制如何改善這些因素,從而達到提高樣品通量的同時獲得更好的數(shù)據(jù)的目的。

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美國Lucigen公司成立于1998年,提供各類用于分子生物學相關(guān)產(chǎn)品,可以使研究者成功克隆較難克隆的基因。2016年,Lucigen收購了Illumina旗下Epicentre部分產(chǎn)品線,2017年代理Epicentre全部產(chǎn)品線,產(chǎn)品主要包括:體外轉(zhuǎn)錄、基因克?。˙AC克隆試劑盒)、感受態(tài)細胞(TG1噬菌體文庫構(gòu)建感受態(tài))、體外擴增、轉(zhuǎn)座子突變、蛋白表達等。

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